马尾是马匹的保护器官。地方品种的马匹生活在环境恶劣、气候寒冷的牧区，少有棚圈，马尾长约一米，尾毛浓密，可以保护后躯和生殖器官，有防寒和保暖作用。马尾又像活动扫把，经常东摇西扫，既可清洁后躯，又可躯赶蚊蝇干扰，使马匹安静采食和休息。改良品种的马匹，特别是长期舍饲的马匹尾毛细而短，冬有厩舍保暖，夏有风扇空调，有饲养员细心冲洗，刷拭、清洁马体修剪鬃、尾。

马尾又是重要的平衡器官，马匹快步跑时，马尾高扬，保持马体重心平衡，利于速力和调节前进方向，有如船和飞机的尾舵。

马尾还与马的体力和健康状况有关。当人们提举马尾时，尾的抵抗力称尾力，据实测最大尾力可达20公斤，平均为10.6公斤。一般而言，神经敏捷，悍威强，工作能力高的马，平均尾力为12.2公斤。